内部控制制度审计是指以内部控制为对象，在评审被审计单位内部控制制度的基础上，决定抽查会计资料的内容、范围和程序，据以进行符合性和实质性测试的一种审计方法。其基本内容包括：

（1）责任控制制度。指以单位内部各部门、层次及人员之间的经济责任为中心的控制制度。一是工作岗位责任制度．即从领导到职工按工作岗位确定的责任扣权力；二是各部门、各层次的责任制，它的对象不是个人，而是部门按各自的职能任务和性质划分的职权．各司其职。各行其权，各尽其责。做到部门与部门、个人与个人之间分工明确、职责清楚，从而做到责任分明、纪律严格、互相协调、效率提高；同时，科学合理而明确的分工也便于部门、个人的相互监督检查．发现问题和纠正错误。

（2）业务处理程序控制制度。指单位内部为全面实现管理目标，通过制定标准程序及实施要求，达到有效控制、取得最大的经济效益。

（3）会计控制制度。

①不相容职务分离控制。其核心是内部牵制，它要求每项经济业务都要经过两个或两个以上的人员或部门进行处理，使得单个人或部门的工作必须与其他人或部门的工作相一致或相联系，并相互监督、制约和牵制，形成相互制衡机制进而防止产生错误和舞弊的可能。

②授权批准控制。主要是指单位在处理经济业务时，必须经过授权批准以便进行控制。单位内部的各级管理层必须在授权范围内行使职权和承担责任，经办人员也必须在授权范围内办理业务。